Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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