Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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