Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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