Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOA1Q15788 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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NCOA1Q15788 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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