Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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