Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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