Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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UBE3CQ15386 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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