Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms