Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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