Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABEP1Q15276 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABEP1Q15276 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABEP1Q15276 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABEP1Q15276 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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