Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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