Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms