Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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COL9A3Q14050 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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