Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms