Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FHL3Q13643 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms