Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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