Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms