Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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