Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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