Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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