Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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