Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms