Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms