Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms