Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms