Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms