Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC010973.1-201ENST00000479085 511 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL389885.1-201ENST00000447227 384 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC137630.4-201ENST00000609473 479 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RGS17-201ENST00000206262 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 IGLC2-201ENST00000390323 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 IGLC3-201ENST00000390325 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms