Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms