Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms