Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms