Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX1P78337 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms