Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms