Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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