Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP107P57740 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms