Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms