Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms