Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMK2P53671 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMK2P53671 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms