Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms