Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3BP49841 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3BP49841 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms