Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms