Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSFMP43897 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSFMP43897 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSFMP43897 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms