Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms