Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms