Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms