Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGP37231 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms