Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms