Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPC1P35052 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms