Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms