Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E1P29083 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms