Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD38P28907 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms